Make
「~にする」「~の状態にする」という意味の動詞です。ここでは命令形です。
sure
「確かな」「確信している」という意味の形容詞です。Make sure で「確実に~する」「必ず~する」という意味になります。
it
直前に述べられたものや状況を指す代名詞です。
is
be 動詞の現在形です。
handled
「~を扱う」「~に触れる」という意味の動詞 handle の過去分詞で、ここでは受動態を形成しています。
with
「~を持って」「~を伴って」という意味の前置詞です。
clean
「清潔な」「きれいな」という意味の形容詞です。
hands
「手」という意味の hand の複数形です。