The flood
「その洪水」を指します。
being
「~であるので」「~であることから」という理由や状態を表す分詞構文です。
an act of God
「天変地異」「不可抗力」を指します。
released
「~を解放した」「~を免除した」という意味です。
the city
「その市」「都市」を指します。
from its obligation
「その義務から」という意味です。
to rebuild
「再建すること」という不定詞です。
immediately
「直ちに」「すぐに」という意味です。