If your system
「もしあなたのシステムが」という意味で、コンピュータ全体を指します。
is set to
「～に設定されている」という意味です。
IDE mode
「IDEモード」という意味で、古いSATAコントローラの動作モードです。
you might want to
「～したいと思うかもしれない」という控えめな提案を表します。
switch to AHCI
「AHCIに切り替える」という意味です。
for better performance.
「より良いパフォーマンスのために」という意味です。