He called her a witch because she was so good at guessing his thoughts.
彼女が彼の考えを推測するのがとても上手だったので、彼は彼女を魔女と呼んだ。
He
「彼」という代名詞です。
called her
「彼女を~と呼んだ」という意味の動詞句です。
a witch
「魔女」という意味ですが、ここでは「超能力者」や「不思議な力を持つ人」というニュアンスで使われています。
because
「~なので」という意味の接続詞です。
she was so good at
「彼女が~するのがとても上手だった」という意味を表します。
guessing his thoughts
「彼の考えを推測すること」という意味の動名詞句です。