Have
「~を持っているか」という所有を尋ねる助動詞(ここではHave)です。
you
「あなた」という二人称を指します。
handed
「提出した」という意味の動詞handの過去分詞形です。
in
「中に」という方向を示す前置詞ですが、hand inで「提出する」という句動詞を作ります。
your
「あなたの」という所有を表します。
papers
この文脈では「試験の答案」や「レポート」を指します。
yet
「まだ」という意味の副詞で、完了していないことを示唆します。
?
疑問文であることを示します。