in spite of everything

/ɪn spaɪt əv ˈɛvriˌθɪŋ/ イン スパイト オヴ エヴリシング

1. あらゆる困難や状況にもかかわらず

困難な状況や不利な条件があるにもかかわらず、結果が変わらないことや、それでも何かを行う様子を表す際に使われます。
In spite of everything, she managed to finish the project on time. (あらゆる困難にもかかわらず、彼女は時間通りにプロジェクトを終えることができた。)

2. 結局のところ、それでもなお

これまでの困難や状況を踏まえた上で、最終的な結論や譲れない事実、状況の変化がないことなどを述べる際に使われることもあります。
I know you're angry, but in spite of everything, he's still your friend. (怒っているのは分かっているが、それでもやはり彼はあなたの友達だ。)