I
「私」という人を指す代名詞です。
understood
「理解した」という意味の動詞understandの過去形です。
the implications
「含蓄、意味合い」を指します。
of
「~の、~に関する」という所属や関連を示す前置詞です。
his comment
「彼のコメント」を指します。「his」は「彼の」、「comment」は「コメント、発言」です。
even though
「~にもかかわらず」という譲歩を表す接続詞句です。
he didn't say it directly
「彼がそれを直接言わなかった」という意味です。「didn't say」は「言わなかった」、「it」は「それ」、「directly」は「直接的に」です。