You
聞き手である「あなた」を指します。
should
「～すべきである」という助言や義務を表します。
regularly
「定期的に」「規則正しく」という意味の副詞です。
check
「確認する」「点検する」という意味です。
your junk mail filter
「あなたの迷惑メールフィルター」を指します。
to avoid
「～を避けるために」という目的を表す不定詞句です。
missing
「見逃すこと」「逃すこと」という意味です。
legitimate messages
「正当なメッセージ」「正規のメッセージ」を指します。