underlying cause

/ˌʌndərˈlaɪɪŋ kɔːz/ アンダーライイング コーズ

1. 問題や現象の根底にある、本当の原因。

目に見える結果や表面的な問題の裏に隠れている、本当の原因や根源を指す表現です。
We need to identify the underlying cause of the system failure. (システム障害の根本的な原因を特定する必要があります。)
関連
basic cause
original cause