This design
「この設計」、すなわちフォン・ノイマン・アーキテクチャの設計を指します。
simplifies
「~を単純化する」という意味の動詞です。
the computer's structure
「コンピュータの構造」を指します。
but
「しかし」という逆接を表す接続詞です。
can lead to
「~につながる可能性がある」「~を引き起こす可能性がある」という意味です。
the Von Neumann bottleneck
「フォン・ノイマン・ボトルネック」という、このアーキテクチャの潜在的な性能制約を指します。